ну, по идее внешние факторы не должны вести к пессимизации, а то так все бы легко конкурентов из топа могли выкидывать.
все зависит от процента "плохих" ссылок по отношению к общему количеству ссылок. У гугла по любому есть такой порог, и по моему такой подход гугла правильный!
Так, что я бы не советовал ставить ссылки ни с зафильтрованных ни с забаненных сайтов.
сайт должен быть с уник контентом. Я надеюсь это не дэфолтный шоп партнерки).
Ну максимум что могло произойти после прогона это - никакого эффекта от прогона, но никак не песимизация сайта, что-то тут не то.