Для разделов прога Gparted, лучше
livecd качнуть, а если есть диск с убунтой, то можно его использовать. Ну и дальше через Resize/Move. Может потребоваться отключить swap раздел, т.к livecd может его использовать.
А на счёт ISPmanager, я не вкурсах - не работал.
Да, бекап 100% нужно сделать, мало ли чё.