не отменяет, ставь первым с флагом [L] должно помочь
RewriteRule domen.com$ / [L]
типа такого
а вообще включи в апаче логи rewrite, открой и посмотри как в конкретном случае выпоняются преобразования
PS даже так наверно лучше будет
RewriteRule ^domen.com$ / [L]