PHP код:
#!/usr/bin/env python
# coding: utf-8
for _, v in enumerate([x for y in [x.strip().split('.') for x in open('my_file.txt').readlines()] for x in y]):
with open('file_{0}.txt'.format(_), 'w') as outputfile:
outputfile.write(v)
если не огромные файлы, то с нумерацией файлов